NAKAGAWA RYU NINJUTSU - situata nella prefettura di Aomori e organizata da Nakagawa Kohayato.
HAGURO RYU NINJUTSU - situata nella prefettura di Yamagata, fu sviluppata dai monaci guerrieri Shugenja del monte Haguro.
UESUGI RYU NINJUTSU - stabilita da Uesugi Kenshin come una organizazione militare di spionaggio da Usami Suruga-No-Kami Sadayuki nella prefettura di Niigata.
KAJI RYU NINJUTSU - fondata da Kaji Omi-No-Kami Kagehide, alunno del fondatore della Uesugi Ryu, però unita alle radici della Hattori Ryu di Iga, fondata da Hanzo Hattori. Questo clan prende anche il nome di Iga Gumi.
MATSUMOTO RYU NINJUTSU - situata nella prefettura di Tochigi.
MATSUDA RYU NINJUTSU - impiantata nella prefettura di Ibaraki.
KOYO RYU, NINKO RYU y TAKEDA RYU - fondate da Takeda Shingen il cuale utilizava monaci erranti e mercanti come agenti.
FUMA NINPO - situata nella la prefettura di Kanagawa e stabilita da Fuma Kotaro, specialista in guerriglia.
AKIBA RYU e ICHIZEN RYU - ambedue situate nella prefettura di Aichi. Hachisuka Kokoru Masakatsu fu un famoso ninja di questa zona.
MINO RYU NINJUTSU - situata nella prefectura di Gifu, fu sviluppata durante ei governo Saito Dosan, e incluso in seguito, all'interno del grupo di ninjutsu Kurowaga di Koga.
ECHIZEN RYU NINJUTSU - situata nella prefettura di Toyama dai ninja di Iga.
YOSHITSUNE RYU NINJUTSU - stabilita nella prefettura di Fukui e ideata da Yoshitsune Minamoto come una mischia di diversi metodi di spionaggio tramandati da Ise Saburo ed i maestri yamabushi.
KOGA RYU NINJUTSU - creata nella prefettura di Shiga nella regione meridionale del Giappone Constituíta da 53 famiglie specializate in medicina ed esplosivi.Svilupparono molte delle armi ye hstrumenti utilizzati dai ninjas.
IGA RYU NINJUTSU - sviluppata nella prefettura di Mie e formata da 49 familglie che si specializzarono nella realizzazione dei veleni, armi da fuoco e armi típiche. Oscurò totalmente al Koga Ryu per la sua prossimità ed inimicizia.
NEGORO RYU NINJUTSU - sviluppata nella prefettura Wakayama e fondata da Suginobo Myosan, sono maestri nelle armi da fuoco.
SAIGA RYU - sviluppata nella prefettura di Wakayama e fondata da Kishu Saiga, sono specialisti negli esplosivi e armi da fuoco.
NATORU RYU - sviluppata nella prefettura di Wakayama e fondata da Natori Sanjuro Nasatake, autore dello Sho Nin Ki Ninjutsu e del Kishu Ryu Ninjutsu.
BIZEN RYU NINJUTSU - situata nell' Okayama.
FUKUSHIMA RYU NINJUTSU - situata nella prefettura di Shimane e transmiessa da Nojiri Jiro Jirouemon Narimasa.
KURODA RYU NINJUTSU - impiantata a Fukuoka e con il supporto della famiglia governativa di Kuroda.
NANBAN RYU NINJUTSU - impiantata nella prefettura di Nagasaki.
SATSUMA NIN-PO - situata nella prefettura di Kagoshima e protetta dalla famiglia governativa dei Shimazu.
GYOKKO RYU - sviluppata nella provincia di Iga e creata da Hakuunsai Tozawa, specializzato nel combattimento senza armai introdotta dal guerriero cinese Cho Gyokko (Koshi Jutsu).
KUKUSHINDEN RYU - fondata da Izumo Kanja Yoshiteru, si specializzarono in shuriken y dakentai.
KOTO RYU - fondata da Sandayu Momochi, sono specialisti nel Koppojutsu.
GIDAN RYU - fundata da Sanyu Hangan gikanbo, daimyo di Kawachi.
TAKAGI YOSHIN RYU - funadata da Oriuemon Sigenobu Takagi, si specializarono in jutaijutsu.
KUMOGAKURE RYU NINJUTSU - fondata por Heinaizaemon Ienaga Iga.
TOGAKURE RYU NINJUTSU - fondata da Daisuke del popolo di Togakure, nella provincia di Iga.
KYUSHIN RYU - specialisti nelle tecniche di katana e yari.
KUSUNOKI RYU - fondata nella metà del secolo.XIV dal famoso guerriero Masahine Kusunoki.
TSUDA RYU - specialisti in kajutsu.
NOTA: Questa lista è una copia dell'artíicolo "Escuelas Tradicionales de Ninjutsu" dal libro "Ninjutsu No Sho - el arte secreto" de Pau Ramón, editorial Alas (1988).